大理－文献名邦，清人孙髯翁在《昆明大观楼长联》中所写的“元跨革囊”四字，概括了元世祖忽必烈灭大理，建立云南行省的壮举。元宪宗蒙哥为了实现灭亡南宋，统一中国愿望，决定采取先征服云南、四川，构成对南宋迂回包围的战略。公元１２５３年，他派其弟忽必烈率兵１０万，从宁夏出发，经甘肃、四川，分兵３路入云南。忽必烈的中路军“乘革囊”（羊皮筏子），巧渡金沙江，攻占了文献名邦－大理国都城－羊苴咩城，大理国王段兴智逃到善阐（今昆明）后，被元追兵俘获，大理国到此灭亡。
大理国王段兴智被俘后，向元宪宗蒙哥，呈献了云南地图后，被封为“摩诃罗嵯”（意为大王）。公元１２７４年，赛典赤－瞻思丁治滇（云南），建立云南行省，大理改为路，大理国王段实为“大理总管”，掌管军政大权，下设姚州、云南州、邓川州、蒙化州、永昌府、腾冲州及鹤庆路，原大理国大、小领主，仍世袭各路、府、州、县的官吏。明洪武１５年（１３８２年），明军攻破大理，大理总管段氏、鹤庆路总管高氏出降，明改设大理府，领太和（今大理）、赵州（今大理凤仪、大理弥渡、祥云）、邓川州（今大理洱源）、宾川州、云龙州以及１２关长，蒙化府、鹤庆军民府领剑川州及顺宁州。明朝时期在云南实行屯田制度以后，建立卫、所，设大理、洱海（今祥云）、大罗、蒙化４个卫以及鹤庆、永平二千户所。明末大西军李定国保永历帝入云南，到清康熙二十一年（１９８１年）吴三桂在昆明杀害永历帝，明王朝在云南的统治结束。
清朝仍沿袭明朝建制，云南省下设府、州、县及直隶厅。大理府属迤西道，辖大理赵州、邓川州、宾川州及太和县、浪穹县、云南县及永平县。剑川州、鹤庆州属丽江府；永平县属永昌府；蒙化（今大理巍山）设直隶厅。清咸丰六年（１８５６年），爆发了以大理回族杜文秀为首的云南滇西各民族大起义，称为总统兵马大元帅，在大理建立政权达１８年之久。辛亥革命后设大理、凤仪、祥云、弥渡、宾川、云龙、漾濞、洱源、邓川、永平、鹤庆、剑川、蒙化等１３县。１９３６年中国工农红军二方面军经大理祥云、宾川、鹤庆等县。１９４９年初在党的领导下在滇西开展革命装武斗争，建立中国人民解放军滇黔桂边区纵队第七、第八支队，迎接中国人民解放军进军云南。１９４９年１２月９日，云南省主席卢汉宣布起义，云南和平解放，大理获得新生。
