丽江古城通安州与大叶场，至元十三年（１２７６），元朝置丽江路，把茶罕章管民官改为丽江路军民总管府。次年，把三赕改为丽江古城通安州。到公元１２８５年，又把丽江路军民总管府改设为丽江路宣抚司，辖区扩大到一府、七州、一县。七州之一为丽江古城通安州。
自此，唐宋时的三赕城，始以丽江古城通安州城的名分出现在历史上，并成为丽江古城土司的政治、经济、文化中心。元代的通安州城即丽江古城，俗称“大叶场”，这里的“叶”指古丽江纳西支系叶（尤）氏族，“场”为丽江纳西语“城”之意，“大”概指当时丽江叶（尤）氏族在丽江纳西四支系中已处于尊大位置。“大叶’，二字以后便演变成“大研”，“大叶场”乃是其后“大研厢”丽江古城的先声。
元代百余年，坐镇丽江古城通安州、大叶场的丽江纳西首领，除阿琮阿良外，还有四代：阿良阿胡、阿胡阿烈、阿烈阿甲、阿甲阿得。阿良阿胡，至元六年（１２６９），为茶罕章管民官而袭元帅。《木氏宦谱》说，他于“成宗元贞元年，蒙皇帝圣旨褒嘉，钦此钦遵，颁给龙章祗领，得恩荣诰命，授正奉大夫护军宣慰司”。“宦谱”没有记他更多的事，但在《元史》和《经世大典．征缅录》中，却记载了阿良阿胡从征人缅，因受贿而被处死之事：大德四年即公元１３００年，缅甸有个阿散哥，杀缅王自立，缅王子请求元朝出兵平乱，元王朝派阔阔亲王和云南平章政事薛超儿等前往，征缅大军一万多人，除元兵外还有云南土司兵，这当中就有丽江路阿良阿胡率领的兵马。大军于１２月中旬在木连城围住阿散哥，围了一个多月，阿散哥只好派人带上金银宝物向元军求降。元军要阿散哥亲自前来，如果他不来，元军就围他一年。殊不知过了二十来天，万户章吉察儿等借口天热发瘴疠而撤了兵。缅王后乘大象赶来，要求元兵再围五天，阿散哥一定会出来投降，但元军不听，征缅无功。后来元朝丞相奉旨追查，才知道阔阔亲王以下将领都受了阿散哥的贿赂。在处置各将领时，把土官阿康、察罕不花两人处决了。《征缅录》中注明土官“察（茶）罕不花”为丽江路宣抚司，即阿良阿胡。
阿胡阿烈，继父阿良阿胡袭元帅职，其弟阿胡阿吉于元顺帝至元十五年（即至正九年，公兀１３４９年），授巨甸军民官安抚司。阿烈并授太中大夫，轻车都尉总管。阿烈阿甲，字元德，于元顺帝至元二十二年（至正十六年，公元１３５６年），为丽江古城通安州知州，授朝清大夫。阿甲阿得，元末任丽江古城通安州知州，后升任丽江宣抚副使。他是元明之交的过渡者，于明洪武十五年（１３８２），成为明代首任丽江知府而名著史册。
元代，丽江古城与外界的交通有了很大改善，所设马站、驿站，已是“星罗棋布，脉络相通，朝令夕至，声闻毕达”。到丽江古城来的中原人士逐渐增多，除官员之外，还有文人墨客，在他们的诗文和著作中，对丽江古城的描述也就多起来了。李京的《云南志略》，对丽江古城的经济、文化、民俗等均有记述。
在《元一统志》中，对丽江古城的记述也不少。如说“霓溪（今丽江黑龙潭）源出州北二里药渠和山（象山）下，旋绕州境”，已道出丽江古城玉河水当时就已绕丽江古城穿流的景象。
元初，赛典赤倡导儒学，使云南各路建学校，立孔庙，丽江古城也先后设学。元代文人王惠、王升父子俩，先后到丽江倡导汉文化，推行儒学，出现了“庙宇圣像一新”的情景。大德年间，丽江古城宣慰副使李京来到丽江城，被雄奇壮美的丽江玉龙雪山所倾倒，写下了一首脍炙人口的《雪山歌》：
在丽江玉龙雪山面前，五岳之中的衡山、华山成了小丘矮垤，这是李京的独特感受。宣文阁博士王沂，到丽江古城，也写有一首《雪山》诗：
在李京的《云南志略》中，写到类似的丽江纳西风俗也不少，如写到“人死，则用竹箦舁至山下，无棺椁，贵贱皆焚一所，不收其骨；非命死者，则别焚之”，反映出元代丽江纳西族还盛行火葬。又如写到丽江古城纳西人“不事神佛，惟正月十五日登山祭天，极严洁。男女动百数，各执其手，团旋歌舞以为乐”，则反映出丽江东巴祭天仪式在元代丽江古城极为普遍。
